Bienvenidos/as a AEXPE. La espondiloartritis anquilosante puede ser una enfermedad debilitante que se manifiesta principalmente con lumbalgia crónica y rigidez, y también puede acompañarse de artritis, inflamación ocular y/o del tubo digestivo. Son una familia heterogénea de enfermedades reumáticas interrelacionadas. La espondilitis anquilosante es la más frecuente de todas las espondiloartritis. Se trata de una enfermedad inflamatoria crónica, que afecta fundamentalmente a las articulaciones de la columna vertebral. La padecen generalmente personas jóvenes y, especialmente, hombres entre los 15 y 25 años. En las mujeres suele ser más leve y, por ello, muchas veces es más difícil de diagnosticar. + Info en CEADE Coordinadora Española de Asociaciones de Espondiloartritis
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miércoles, 20 de junio de 2012

GENOMA HUMANO

INVESTIGADORES DEL IDIBELL COMPLETAN EL PRIMER EPIGENOMA DE EUROPA

Un estudio liderado por Manel Esteller compara las marcas epigenéticas de una persona sana con las de una paciente con una enfermedad genética

Un estudio liderado por Manel Esteller, director del Programa de Epigenética y Biología del Cáncer del Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL), profesor de genética de la Universidad de Barcelona e Investigador ICREA, ha completado el primer epigenoma de Europa. El hallazgo se publica en la revista científica internacional Epigenetics.
El genoma de todas las células del cuerpo humano con independencia de sus aspectos y funciones es lo mismo, por lo tanto no puede explicar completamente la actividad de los tejidos y órganos ni sus trastornos en enfermedades complejas como el cáncer. Se necesita algo más. Parte de la explicación la proporciona la epigenética, un campo de la biología que estudia la herencia de la actividad del ADN que no implica cambios en la secuencia del mismo. Es decir, si la genética es el abecedario, la epigenética es la ortografía que guía la actividad de nuestras células.

Metilación

La epigenética hace referencia a modificaciones químicas en nuestro material genético y en las proteínas que lo regulan. La marca epigenética más reconocida es la metilación, la adición de un grupo químico metilo (-CH3) en nuestro ADN. El epigenoma está constituido por todas las marcas epigenéticas de un ser vivo.
Los autores del estudio han completado los epigenomas correspondientes a todas las marcas de metilación del ADN de los glóbulos blancos de la sangre de dos chicas: una sana y otra con una enfermedad genética minoritaria, denominada síndrome de inmunodeficiencia, inestabilidad centromérica y anomalías faciales (ICF). Esta afección está provocada por una mutación en un gen que provoca la adición de un grupo químico metilo en su ADN.
El análisis realizado por los investigadores revela que la paciente posee un epigenoma defectuoso que provoca la fragilidad de sus cromosomas, que de esta manera se pueden romper muy fácilmente. Además, el estudio muestra que posee un control epigenético erróneo de muchos genes relacionados con la respuesta contra las infecciones, lo que le causa un déficit de inmunidad severo.
El coordinador del estudio, Manel Esteller, destaca que, gracias a este estudio, “ahora sabemos qué sucede en este tipo de enfermedades raras y podemos empezar a pensar estrategias de nuevos tratamientos basados ​​en este conocimiento.”
El doctor Esteller es un referente internacional en el ámbito de la epigenética. Su trabajo ha sido decisivo para demostrar que todos los tumores humanos tienen en común una alteración química concreta: la hipermetilación de los genes supresores de tumores. Desde el año 2008 es el director del programa de Epigenética y Biología del Cáncer del IDIBELL.

viernes, 9 de marzo de 2012

GENOMA HUMANO

EL GENOMA DEL SER HUMANO SE ASEMEJA MÁS AL DE UN GORILA QUE AL DE UN CHIMPANCÉ

Un equipo de investigadores británicos ha completado la secuencia del genoma del gorila, publicando sus hallazgos en la revista 'Nature'. Aunque confirman que nuestro pariente más cercano es el chimpancé, los investigadores muestran que la mayor parte del genoma humano se asemeja más a la de un gorila, que a la de un chimpancé. Esta es la primera vez que los científicos han podido comparar los genomas de los cuatro grandes simios vivos: humanos, chimpancés, gorilas y orangutanes, proporcionando una perspectiva única sobre nuestros propios orígenes, y consiguiendo un importante recurso para la investigación de la evolución humana, la biología, y la conservación de los gorilas.
"El genoma del gorila es importante porque arroja luz sobre el momento en que nuestros ancestros se separaron de nuestros parientes evolutivos más cercanos. También, nos permite explorar las similitudes y diferencias entre nuestros genes y los de los gorilas, el mayor primate viviente", afirma el primer autor, Aylwyn Scally, del Instituto Wellcome Trust Sanger, quien explica que, "usando de ADN de Kamilah, una hembra de gorila, se conformó una secuencia del genoma del gorila, que fue comparada con los genomas de los otros grandes simios".
El equipo buscó -en más de 11.000 genes de chimpancés, humanos, y gorilas- los cambios genéticos importantes en la evolución, descubriendo que los humanos y los chimpancés son genéticamente más próximos entre sí, en la mayor parte del genoma. Sin embargo, el equipo encontró muchas secuencias donde esto no se cumplía: el 15% del genoma humano está más cerca del genoma del gorila que del de chimpancé, y el 15% del genoma del chimpancé está más cerca del gorila que del humano.
En las tres especies, los genes relacionados con la percepción sensorial auditiva y el desarrollo del cerebro mostraron una evolución acelerada -particularmente en los seres humanos y los gorilas.
Según el coautor, el doctor Chris Tyler-Smith, del Instituto Wellcome Trust Sanger, "los gorilas comparten muchos cambios genéticos paralelos con los humanos, incluyendo la evolución del sistema auditivo. Los científicos, anteriormente, habían sugerido que la rápida evolución de los genes del sistema auditivo humano estaba vinculada a la evolución del lenguaje. Sin embargo, nuestros resultados ponen esto en duda, ya que los genes de la audición han evolucionado en los gorilas a un ritmo similar al de los humanos".
El equipo descubrió que la divergencia entre los gorilas, los seres humanos y los chimpancés, se produjo hace alrededor de diez millones de años. "Nuestra investigación genética completa el cuadro de las comparaciones generales de los grandes simios", afirma el doctor Richard Durbin, coautor del estudio, del Instituto Wellcome Trust Sanger, quien concluye que "después de décadas de debate, nuestras interpretaciones genéticas son coherentes con el registro fósil, y proporcionan una nueva herramienta para que paleontólogos y genetistas puedan trabajar dentro del mismo marco". (Foto ayuntamiento de Barcelona).

Fuente: www.europapress.es






martes, 28 de febrero de 2012

GENOMA HUMANO

ESTUDIO HALLA QUE UN 1 POR CIENTO DE LOS GENES HUMANOS ESTÁN INACTIVOS

Científicos que estudian el genoma humano descubrieron que cada uno de nosotros porta alrededor de 20 genes que han estado completamente inactivos, lo que sugiere que no todos los genes desactivados son dañinos para la salud.
Un equipo del Instituto Sanger de Gran Bretaña está desarrollando un nuevo catálogo de lo que denominó variaciones genéticas con "pérdida de la función" (LoF por su sigla en inglés) para ayudar a identificar nuevas mutaciones causantes de enfermedad, y señala que su trabajo ayudará a los científicos a comprender mejor el funcionamiento normal de los genes humanos.
Como parte de un estudio más amplio llamado Proyecto 1.000 Genomas, el equipo creó una serie de filtros para identificar errores comunes en el genoma humano, o código genético completo.
"Las preguntas clave en que nos concentramos para este estudio fueron cuántas de esas variaciones LoF eran reales y qué rol jugarían en la enfermedad humana", dijo Daniel MacArthur, del Instituto Sanger, que trabajó en el equipo.
Los investigadores observaron casi 3.000 posibles variaciones LoF en los genomas de 185 personas de Europa, Asia oriental y África occidental. Sus hallazgos fueron publicados en la revista Science.
Las variaciones LoF son cambios genéticos que están previstos para interrumpir severamente la función de los genes. Algunas son conocidas por causar enfermedades humanas como la distrofia macular y la fibrosis quística.
Los proyectos previos de secuenciación del genoma han sugerido que hay cientos de estas variantes en el ADN, incluso de los individuos perfectamente saludables, pero los investigadores no habían podido decir exactamente cuántos.
En este estudio, los filtros revelaron que en el 56 por ciento de las 3.000 posibles LoF analizadas era poco probable que se viera afectada la función genética.
Pero de las variantes LoF reales, 100 suelen hallarse en el genoma de cada europeo, indicaron los investigadores, y 20 afectan a ambas copias del gen, lo que implica que provocarán la pérdida completa de su función.
"Esto muestra que al menos el 1 por ciento de los genes humanos pueden apagarse sin causar enfermedad grave", dijo Mark Gerstein, profesor de informática biomédica de la Yale University en Estados Unidos, quien también trabajó en la investigación.
"Pudimos usar la diferencia entre estos genes 'tolerantes a la LoF' y aquellos que sabemos que provocan enfermedad en los humanos para desarrollar una forma de predecir si un nuevo cambio descubierto en un gen es proclive o no a causar enfermedad grave", agregó Gerstein.
Chris Tyler-Smith, que dirigió al equipo en el Instituto Sanger, señaló que los hallazgos serían inmediatamente útiles para los actuales estudios de secuenciación del ADN en pacientes con enfermedades específicas.
Los resultados generaron una lista de más de 1.000 variaciones LoF, dijo el autor, "y en la mayoría de los casos se sabe poco o nada sobre cómo funcionan esos genes o qué hacen".
"Estudiando en detalle a las personas que los portan, deberíamos obtener nuevas perspectivas sobre el funcionamiento de muchos genes humanos poco conocidos", finalizó Tyler-Smith.





martes, 7 de febrero de 2012

GENOMA HUMANO

NUEVOS MÉTODOS PARA MEDIR CON MAYOR
PRECISIÓN LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA

Investigadores del Instituto Courant de Ciencias Matemáticas de la Universidad de Nueva York (Estados Unidos) han evaluado algunos de los métodos actuales para secuenciar genomas, en un estudio individual que sirve como una "prueba de estrés" de la eficacia de estas prácticas que publica la revista 'PLoS One'.
Aunque el primer genoma completo se secuenció hace una década, debido a la amplia variación genética de los siete mil millones de personas en el mundo --y las diferencias en la distribución, incluso entre parientes cercanos-- la cuestión de la secuencia exacta del genoma individual sigue siendo un reto para los científicos.
Con las empresas que afirman que pueden secuenciar un genoma por 1.000 dólares --muy por debajo de los 25.000 dólares que pedían unos pocos años atrás-- y los esfuerzos para desarrollar medicamentos personalizados, este asunto está adquiriendo mayor importancia en el mercado actual. Estos esfuerzos se basan en el abaratamiento de las nuevas tecnologías, que suponen que los científicos pueden seguir utilizando el enfoque estándar cortando el genoma, al azar, en pedazos más pequeños, y montándolo, luego, algorítmicamente.
En concreto, un menor coste se logra mediante la ruptura del ADN en pedazos aún más pequeños, leyendo, de forma rápida y barata, una gran cantidad de ellos. Sin embargo, no está claro cómo evaluar la exactitud de los algoritmos de montaje, sobre todo si la exactitud de los datos genómicos anteriores es cuestionable. Uno de los desafíos específicos es confirmar si la exactitud de la secuencia del genoma de un individuo es coincidente con el fenotipo de esa persona, con un rasgo físico, con el genotipo que le afecte, o con su estructura genética.
Para ello, en este trabajo los investigadores emplearon procedimientos que tienen como objetivo identificar las características principales del genoma, así como la forma en que cada una de estas características se relaciona con las demás.
"La mayoría de las tecnologías actuales, en el montaje de un genoma, cometen varios tipos de errores cuando se encuentran con la repetición de una región -donde una subcadena de las letras que forman las hebras de ADN re-ocurre en muchos lugares en el genoma", explica Bud Mishra, profesor de Ciencias de la Computación y las Matemáticas y autor principal del estudio, quien añade que "la entrada de lecturas aleatorias tiende a acumularse en uno de estos centros, mostrando discrepancias".
Para probar la viabilidad de estos procedimientos, los investigadores se basaron en el conjunto de características de un software de código abierto, AMOS, desarrollado por un consorcio público de genomicistas y bioinformáticos. Si un método ha secuenciado, exactamente, el genoma completo de un individuo, según la hipótesis de los investigadores, los componentes de la creación de ese método deben encajar y ser consistentes con otros datos auxiliares como los pares de parejas, los mapas ópticos o las secuencias estroboscópicas, todo lo cual constituye, a largo plazo, la información del genoma. En la actualidad, el uso de pares de parejas es muy común en la secuencia de montaje y validación de los algoritmos, pero no los otros dos.
Mientras se buscaban deficiencias en todos los métodos examinados para la secuenciación del genoma de un individuo, algunos ensamblajes se mostraron prometedores. Las conclusiones de los investigadores de Universidad de Nueva York se derivan de un procedimiento llamado Feature-Response Curve, que muestra una imagen global de cómo diferentes ensamblajes son capaces de hacer frente a diferentes regiones y estructuras en un genoma grande y complejo.

Fuente: www.europapress.es




martes, 24 de enero de 2012

GENOMA HUMANO

El proyecto Genoma Humano secuenció la información genética contenida en el 10% de las células que forman el cuerpo humano. El 90% restante no son células humanas sino un auténtico ecosistema de unos cien billones de bacterias que habitan en nuestro cuerpo. Reciben el nombre de microbioma, y la ciencia está descubriendo cada día nuevas pruebas que demuestran que son fundamentales para nuestra supervivencia. Como explica el doctor Francisco Guarner, responsable del grupo de Fisiología y Fisiopatología Digestiva del Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), "el microbioma se considera ya un órgano en sí mismo".
Las alteraciones que se producen en esta población de microorganismos tienen serias consecuencias para la salud; de hecho influyen hasta tal punto en el cuerpo que pueden llegar a modificar la conducta y el desarrollo cerebral. Hay estudios que demuestran que animales de laboratorio que crecen en total ausencia de bacterias tienen un desarrollo corporal deficiente, un cerebro distinto e inmaduro y su sistema inmunitario es incompleto. Lo sorprendente "y una de las razones que justifica el considerar el microbioma como órgano", explica Guarner, "es que si a estos animales se les trasplanta la flora de individuos normales, recuperan la normalidad".
Una de las opciones terapéuticas en estudio es restaurar la población de bacterias y alterar el sistema inmunitario del paciente mediante el consumo de probióticos o de determinados gusanos helmintos (parasitarios) no patógenos.
El siguiente gran paso biomédico después de lograr secuenciar el genoma humano es el proyecto europeo MetaHIT (Metagenómica del Tracto Intestinal Humano) . Su objetivo es ambicioso: descifrar el material genético de las más de 150.000 especies distintas de microbios que colonizan el cuerpo humano. Guarner, responsable español de MetaHIT, explica: "Vamos a generar un catálogo de las bacterias simbióticas que viven y participan en nuestro cuerpo, sus características y sus funciones".
Este proyecto, en el que participan ocho países europeos, está en marcha desde 2008 y tiene fecha prevista de finalización para junio de 2012.
Los resultados del estudio MetaHIT pretenden tener infinidad de aplicaciones terapéuticas. "El gran objetivo es llegar a entender una parte del cuerpo humano que hasta ahora desconocíamos", explica Guarner. "Si llegamos a conocer al detalle estos dos kilos de células bacterianas que habitan en nuestro cuerpo, entonces podremos utilizar este conocimiento para tratar el autismo, trastornos psiquiátricos tempranos, enfermedades autoinmunes, alergias, trastornos del metabolismo, obesidad o diabetes tipo 2", enumera.







lunes, 22 de agosto de 2011

MEDICINA INDIVIDUALIZADA

Si bien la mayoría de las enfermedades genéticas obedecen a la mutación de un único gen, entre los muchos retos está el aclarar por qué algunos padecimientos se manifiestan sólo cuando se presenta más de una variación.
Otro de los retos es reducir de manera sustancial los costos de secuenciar el genoma humano. En la medida en que esto suceda, será posible descifrar las causas genéticas de más enfermedades en un mayor número de personas específicas.
Pero como no basta con conocer la causa de una enfermedad para tratarla, otro reto de los investigadores es dar con tratamientos que se ajusten a los genes y a las mutaciones genéticas de cada persona en lo particular. Y por el ritmo al que avanza la Ciencia, es de esperar que estos “tratamientos personalizados” no tarden en llegar.
Desde que en el año 2003 se diera a conocer la secuenciación del 99.9% del genoma humano, los descubrimientos sobre las causas de enfermedades genéticas avanzan a un paso tan rápido que los mismos científicos se sorprenden.
Entre los descubrimientos dados a conocer en fecha reciente están los siguientes:
En julio pasado, el periódico especializado Discovery Journal publicó los resultados de un estudio del Centro de Genómica Aplicada del Children´s Hospital of Philadelphia. Mientras buscaban variaciones genéticas en tres miembros de una misma familia que sufren un severo Trastorno por Déficit de Atención con Hiperactividad (TDAH), los científicos dieron con que en uno de los hijos hay también una combinación de dos mutaciones genéticas que son responsables de un desorden sanguíneo cuyas causas se ignoraban.
También en el mes de julio, el New England Journal of Medicine publicó que científicos del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI, por sus siglas en inglés) ubicado en Maryland, encontraron que la mutación del gen AKT1 se asocia con el síndrome de Proteus o enfermedad del Hombre Elefante. Este mal se manifiesta en el crecimiento desproporcionado de tejidos y huesos.
A principios de este mes de agosto, la revista Nature Genetics publicó que la mutación del gen RAD51D está asociada con el cáncer de ovario. El estudio corrió a cargo del Instituto de Investigación del Cáncer del Reino Unido.
Y también en agosto, pero el día 11, la Universidad de Cambridge dio a conocer un trabajo conjunto con la Universidad de Oxford, en el que se encontraron 29 variaciones genéticas asociadas a la esclerosis múltiple, que se sumaron a las 23 ya conocidas. Además, fueron identificadas otras 5 mutaciones que pudieran estar implicadas, mismas que serán estudiadas con más detalle.

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